El ciclo de krebs también se denomina ciclo del ácido tricarboxílico y utiliza acetil coezima A como metabolito de partida, que se obtiene por la acción de la piruvato deshidrogenasa sobre el piruvato producido por la glucólisis.
El ATP y el poder reductor se obtienen del ciclo de krebs; el poder reductor se envía a la cadena respiratoria donde NADH y FADH2 se oxidan respectivamente a NAD + y FAD: el poder reductor se transfiere, a lo largo de la cadena respiratoria, a sistemas de acoplamiento a partir de los cuales se produce más ATP.
El ciclo de krebs es un centro nervioso no solo para el metabolismo de la glucosa sino también para el metabolismo de los ácidos grasos y aminoácidos, de hecho el piruvato que se convierte en acetil coenzima A no proviene solo de la degradación de la glucosa: se obtiene, por ejemplo, también de la transaminación de alanina (un aminoácido).
Aproximadamente el 80% de la acetil coenzima A que participa en el ciclo de krebs proviene del metabolismo de los ácidos grasos.
La acetil coenzima A es un tioéster, por lo que tiene un alto contenido energético que es aprovechado por citrato sintasa para formar un nuevo enlace carbono-carbono; la citrato sintasa es la primera enzima del ciclo de krebs.
El carbono metílico de la acetil coenzima A libera voluntariamente (por tautomería) un protón (se convierte en un carboanión) y ataca el carbono carbonilo del oxalacetato: se forma un tioéster de alto contenido energético (citril coenzima A) a partir del cual, por hidrólisis, se obtiene el citrato. y se reforma la coenzima A. La citrato sintasa es modulada negativamente por el producto, es decir por el citrato y por el ATP: si el citrato se acumula significa que esta etapa es más rápida que las otras por lo que debe ralentizarse (el citrato es un negativo modulador).
El ATP también influye en la acción de la citrato sintasa ya que el poder reductor se obtiene del ciclo de krebs que luego se envía a la cadena respiratoria a partir de la cual se produce el ATP; si se acumula ATP, significa que se produce más de lo necesario. Al ralentizar el ciclo de krebs (el ciclo se ralentiza si una de sus etapas se ralentiza), la producción de ATP también se ralentiza: la modulación negativa de ATP es una modulación de retroalimentación (la formación de uno de los productos finales es modulado ajustando la velocidad de un paso en el proceso).
En la segunda etapa del ciclo de krebs, el citrato se convierte en isocitrato por la acción de la enzima. aconitasa; el nombre de la enzima deriva del hecho de que el citrato se deshidrata primero con la formación de cis-aconitato y, posteriormente, el agua vuelve a entrar uniéndose a un carbono diferente al que estaba previamente unido. El isocitrato se obtiene sin que el sustrato salga del sitio catalítico; la aconitasa es una enzima estereoespecífica: reconoce los tres centros carboxilo del citrato y esto hace que el citrato permanezca unido a la enzima para que la salida y entrada del "agua siempre pase a través del intermedio cis-aconitato.
En la tercera etapa del ciclo de krebs existe la primera consideración energética porque existe la pérdida de un carbono eliminado como dióxido de carbono. La enzima que cataliza esta etapa es la isocitrato deshidrogenasa; el sustrato sufre, en primer lugar, una deshidrogenación: el NAD + adquiere poder reductor y se forma oxalosuccinato (es un derivado oxal del ácido succínico), luego el oxalosuccinato sufre descarboxilación a α-cetoglutarato.
La enzima isocitrato deshidrogenasa tiene dos sitios de modulación: una modulación positiva por ADP y una modulación negativa por ATP. La cantidad de ATP consumida diariamente es muy alta: el ATP aporta la energía liberada por su hidrólisis, "ADP y todo" ortofosfato.
La concentración total de nucleósidos (base nitrogenada más azúcar) y nucleótidos (nucleósido más fosfato) en un organismo es casi constante: decir, por tanto, que c "es mucho ATP o poco ADP (o viceversa, mucho ADP y poco ATP) es lo mismo; ADP es sinónimo de necesidad de energía y es, por tanto, modulador positivo, mientras que ATP es síntoma de disponibilidad energética y, por tanto, modulador negativo.
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