Según los partidarios de la medicina alternativa, al liberar regularmente el intestino de los desechos antes mencionados, todo el organismo debería beneficiarse de él en términos de salud, ya que un tracto entérico "intoxicado" podría crear problemas no solo para el sistema digestivo, sino también para otros aparatos y sistemas del cuerpo, con consecuencias negativas en todo el estado de salud del individuo.
La desintoxicación intestinal en la medicina alternativa se practica a través de una limpieza del intestino que puede tener lugar mediante la adopción de un tipo particular de dieta, con la asunción de remedios naturales particulares y con la ejecución de lavados intestinales.
A pesar del creciente número de personas que se acercan a estos tratamientos alternativos, no existe evidencia científica que pueda confirmar los beneficios. Por el contrario, el uso de estos tratamientos alternativos puede provocar la aparición de efectos secundarios más o menos graves.
